박 전 총장은 증언록에서 "제가 입당할 때 문서로 된 당의 강령과 규약이라는 것을 직접 봤고, 북한산에 올라가서 오른손을 들고 입당선서를 한 뒤 참여를 했다. 서울대학교 재학생으로는 (나를 포함해) 5명이 참여했다"라고 밝혔다.

그는 "첫 번째 인혁당 사건은 제 자신의 체험으로 볼 때 실재했던 사건이었으나 정부 당국이 (물증을 확보하지 못하는 등) 객관화하는 데 실패해서 조작사건처럼 계속 논란이 되고 있는 데에 대해 그때 참여했던 한 사람으로서 마음이 괴로웠다"라고 밝혔다.

1964년 8월 '북한의 사주를 받아 국가 변란을 기도했다'는 중앙정보부 발표로 시작된 제1차 인혁당 사건에서는 주요 관련자 13명이 징역 1~3년 실형이나 집행유예 선고를 받았다. 당시 박 전 총장은 이 사건과 관련해 중정에서 조사를 받았으나 기소되지 않고 풀려났다.

박 전 총장은 28일 본지와의 전화 인터뷰에서 "서울대 정치학과 4학년에 재학 중이던 1963년 봄 인혁당에 입당했다"며 "당시 인혁당의 강령 내용은 '민족 자주적인 정권을 수립해서 북한과의 협상으로 통일을 시도한다'는 것이었다"고 말했다.

당시 중앙정보부가 인혁당을 '국가 변란을 기도한 지하조직'이라고 규정했던 것에 대해서는 "그 말이 맞다"고 했다.

박 전 총장은 또 "인혁당은 조직망과 활동 방식에서 전형적인 좌파 혁명정당의 모습이었다"고 말했다. "위에서 아래로 점(點)조직을 관리하는 비밀조직이었기 때문에 하부에선 상부에 누가 있는지도 몰랐고, 나중에 사건이 불거지고 나서야 알게 됐다"는 것이다.

그는 국정원 과거사위 발표에 대해선 "(과거사위 발표대로) 만약 이념서클이었다면 구성원끼리 누가 누구였는지는 알았어야 할 게 아니냐"며 "그 사람(과거사 위원)들이 제대로 조사할 능력이 없었을 것"이라고 말했다.

박 전 총장은 "떳떳한 모임이었다면 공개적으로 하지 뭐 하러 지하당을 만들었겠느냐"고 반문하기도 했다. 그러나 북한의 지령 여부에 대해선 "(북한과) 직접 연결됐던 것 같지는 않고 자생적인 모임이었다"고 했다.